新疆工学院现为新疆维吾尔自治区人民政府领导管理的应用型本科院校，主要培养区域经济社会发展所需的高素质应用型、技术型人才。

2020年，阿克苏地委、行署围绕经济发展、长治久安的总体目标，积极与新疆大学合作，商讨规划在该地区建设大学，达成规划建设协议。2020年，经自治区人民政府批准，同意将新疆大学管理的科技学院(2002年成立，为民办独立学院)逐步搬迁至阿克苏。2020年，阿克苏地委、行署集资15亿多元，以刻不容缓的紧迫感，于当年3月开始筹建科技学院阿克苏校区，实现当年开工、竣工、招生，创造了新疆的效率，创造了阿克苏在高等教育史上的速度。到2020年，新疆大学科技学院整体搬迁到阿克苏，同年开始筹备搬迁。2020年6月18日，在自治区人民政府和教育部门的大力支持下，经教育部批准，新疆大学科技学院成功搬迁至新疆工业学院(《关于同意新疆工业学院搬迁的函》(交发函[2019]51号))。新疆工学院的成功转移是阿克苏历史上的里程碑，填补了阿克苏高等教育的空白，填补了新疆科技教育的不足，铸就了培养区域高素质人才的摇篮。

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